بررسی کارایی روشLAMP (Loop-mediated isothermal DNA amplification)

author

کرمی, علی

Abstract:

مقدمه:سالمونلاها از مهمترین باکتری های بیماری و عامل تیفوئید، باکتریمی، آنتروکولیت و سالمونلوز است که از عفونت های مشترک انسان و حیوانات می باشد. بیماریهای ناشی از این عامل یک معضل بزرگ بهداشتی در جهان به خصوص در کشورهای در حال توسعه از جمله کشور ما می باشد. بنابراین تشخیص سریع، دقیق و به موقع آن برای جلوگیری از اپیدمی و عوارض مخرب این باکتری ضروری به نظر می رسد. برای تشخیص سالمونلا روش های مختلفی وجود دارد که می توان به روش کشت، Immunoassay، و روش های مولکولی PCR ، Real-time PCR اشاره نمود. تمام این روش ها به زمان طولانی، تعداد زیاد باکتری درنمونه اولیه، تجهیزات گران قیمت آزمایشگاهی و به افراد متخصص در این زمینه نیاز دارند. هدف از این مطالعه بررسی کارایی روش نوین تشخیص مولکولی LAMP با روش PCRدر تشخیص عامل عفونی ســالمونلا تیفی می باشد. مواد و روش ها: در این تحقیق روش PCR با روشLAMP جهت تشخیص 7 سویه سالمونلای مختلف مورد بررسی و مقایسه قرار گرفتند. ژنوم باکتری ها طبق روش استاندارد استخراج و با پرایمرهای اختصاصی در دستگاه PCR بر اساس برنامه چرخه حرارتی تشخیص داده شدند. و در مقایسه با آن مجموعه پرایمرهای اختصاصی به روش LAMPدر یک دمای واحد در بلوک حرارتی ساخته شده در داخل کشور تکثیر و محصولات ایجاد شده در ژل الکتروفورز از طریق بررسی ایجاد کدورت به روش چشمی مورد تشخیص قرار گرفتند. یافته های پژوهش: بررسی نتایج دو روش در تشخیص مولکولی سالمونلاها نشان داد که روشLAMP سریعتر، ارزان تر و اختصاصی تر است و به جای دستگاه گران قیمت PCR و برنامه چرخه حرارتی چند دمایی آن با استفاده از یک بلوک حرارتی بسیار ساده و ارزان ساخت داخل کشور و در یک دمای واحد 62 درجه سانتی گراد و همچنین با مشاهده کدورت حاصل از فرایند تکثیر ژن ها در روش جدید در مقایسه با روش الکتروفورز در بررسی محصولات PCR در زمان کوتاه تری به تشخیص اختصاصی این سالمونلا ها پرداخت. بحث و نتیجه گیری: این روش می تواند جهت تشخیص مولکولی سریع، دقیق و ارزان با کاربرد گسترده در آزمایشگاه های تشخیصی و بخصوص تشخیص عوامل عفونی در آزمایشگاه های مناطق محروم و همچنین آزمایشگاه های سیار مورد استفاده قرار گیرد.

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

بررسی کارایی روشlamp (loop-mediated isothermal dna amplification)

full text

Loop-mediated isothermal amplification of DNA.

We have developed a novel method, termed loop-mediated isothermal amplification (LAMP), that amplifies DNA with high specificity, efficiency and rapidity under isothermal conditions. This method employs a DNA polymerase and a set of four specially designed primers that recognize a total of six distinct sequences on the target DNA. An inner primer containing sequences of the sense and antisense ...

full text

Loop-mediated isothermal amplification for human influenza A viruses

No abstract

full text

Loop-Mediated Isothermal Amplification Targeting Actin DNA of Trichomonas vaginalis

Trichomoniasis caused by Trichomonas vaginalis is a common sexually transmitted disease. Its association with several health problems, including preterm birth, pelvic inflammatory disease, cervical cancer, and transmission of human immunodeficiency virus, emphasizes the importance of improved access to early and accurate detection of T. vaginalis. In this study, a rapid and efficient loop-media...

full text

Loop-mediated isothermal amplification: Beyond microbial identification

Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay was introduced in the year 2000 by Notomi, as a highly sensitive, specific, and cost-effective technique for microbial identification. LAMP, a simple DNA amplification technique, with its fieldamenable nature has been used to detect a variety of pathogens including viruses, fungi, bacteria, and parasites and in most of the cases it surpasses p...

full text

Electric LAMP: Virtual Loop-Mediated Isothermal AMPlification

We present eLAMP, a PERL script, with Tk graphical interface, that electronically simulates Loop-mediated AMPlification (LAMP) allowing users to efficiently test putative LAMP primers on a set of target sequences. eLAMP can match primers to templates using either exact (via builtin PERL regular expressions) or approximate matching (via the tre-agrep library). Performance was tested on 40 whole ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

Journal title

مجله دانشگاه علوم پزشکی ایلام

volume 17 issue 3

pages 1- 10

publication date 2009-10

unfollow

{@ msg @}

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com